-
สนธิสัญญาทางไมตรี
ลงนามเมื่อวันที่ 3 มีนาคม 2497
-
ความตกลงว่าด้วยการแบ่งเขตไหล่ทวีประหว่างประเทศทั้งสองในตอนเหนือของช่องแคบมะละกาและในทะเลอันดามัน
ลงนามเมื่อวันที่ 17 ธันวาคม 2514
-
ความตกลงระหว่างไทย-อินโดนีเซีย-มาเลเซีย ว่าด้วยการแบ่งเขตไหล่ทวีปในตอนเหนือของช่องแคบมะละกา
ลงนามเมื่อวันที่ 21 ธันวาคม 2514
-
ความตกลงว่าด้วยการแบ่งเขตกั้นทะเลระหว่างประเทศทั้งสองในทะเลอันดามัน
ลงนามเมื่อวันที่ 11 ธันวาคม 2518
-
สนธิสัญญาว่าด้วยการส่งผู้ร้ายข้ามแดน
ลงนามเมื่อวันที่ 29 มิถุนายน 2519
-
ความตกลงว่าด้วยการยกเว้นการเก็บภาษีซ้อน
ลงนามเมื่อวันที่ 25 มีนาคม 2524
-
ความตกลงว่าด้วยความร่วมมือด้านป่าไม้
ลงนามเมื่อวันที่ 27 พฤษภาคม 2527
-
บันทึกความเข้าใจว่าด้วยความร่วมมือด้านถ่านหิน
ลงนามเมื่อวันที่ 12 มกราคม 2533
-
บันทึกความเข้าใจว่าด้วยความร่วมมือด้านวิทยาศาสตร์ การวิจัย และเทคโนโลยี
ลงนามเมื่อวันที่ 21 พฤษภาคม 2533
-
ความตกลงว่าด้วยความร่วมมือทางเศรษฐกิจและวิชาการ
ลงนามเมื่อวันที่ 18 มกราคม2535
-
ความตกลงว่าด้วยการส่งเสริมและคุ้มครองการลงทุน
ลงนามเมื่อวันที่ 17 กุมภาพันธ์ 2541
-
ความตกลงด้านวัฒนธรรม
ลงนามเมื่อวันที่ 17 มกราคม 2545
-
บันทึกความเข้าใจว่าด้วยความร่วมมือด้านการท่องเที่ยว
ลงนามเมื่อวันที่ 23 พฤษภาคม 2546
-
ความตกลงว่าด้วยการบริการทางอากาศ
ลงนามเมื่อวันที่ 7 มีนาคม 2511 ปรับปรุงแก้ไขเมื่อวันที่ 2 มีนาคม 2547
-
บันทึกความเข้าใจว่าด้วยความร่วมมือด้านการลงทุน
ลงนามเมื่อวันที่ 21 กรกฎาคม 254
-
บันทึกความเข้าใจว่าด้วยความร่วมมือด้านการเกษตร
ลงนามเมื่อวันที่ 16 ธันวาคม 2548
-
บันทึกความเข้าใจการซื้อขายข้าวระหว่างรัฐบาลไทยกับรัฐบาลอินโดนีเซีย
ลงนามเมื่อวันที่ 26 ธันวาคม 2549
-
บันทึกความเข้าใจว่าด้วยการสถาปนาความสัมพันธ์บ้านพี่เมืองน้องระหว่างจังหวัดเชียงใหม่กับจังหวัดยอกยาการ์ตา
ลงนามเมื่อวันที่ 4 กันยายน 2550
-
บันทึกความเข้าใจว่าด้วยความร่วมมือด้านการศึกษา
ลงนามเมื่อวันที่ 27 มกราคม 2554
-
ความตกลงทางการค้า (Trade Agreement)
ลงนามเมื่อวันที่ 16 พฤศจิกายน 2554
-
ข้อตกลงว่าด้วยการแก้ไขบันทึกความเข้าใจว่าด้วยการซื้อขายข้าวระหว่างรัฐบาลไทยกับรัฐบาลอินโดนีเซีย
ลงนามเมื่อวันที่ 16 พฤศจิกายน 2554